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荷斯坦公牛非补偿性繁殖力的全基因组联合分析

作者:孟宪宝 秦波 张凯奶牛繁殖力snp多态性基因组筛选

摘要:对牧场来说,提高繁殖力是一个非常重要的目标。牧场中,奶牛不孕症中的一部分是公牛不孕,公牛不孕可以分为补偿性和非补偿性两类。补偿性不孕可以通过提高精子数量来克服。非补偿性不孕则是与遗传缺陷有关。通过将单核苷酸多态性(SNP)与公牛非补偿性繁殖力相结合进行评估,很有可能确认出影响这一性状的基因组区域。在选择上应用这一信息,可以提高奶牛繁殖力,从而获得经济效益。在本研究中,高密度SNP基因型和非补偿性繁殖力数据来自795头荷斯坦公牛,用于评估SNP与繁殖力的关联性。采用贝叶斯B分析来获得基因组筛选的进一步信息以及确认与非补偿性繁殖力相关联的基因组区域。交叉验证方法用于评估以795头公牛原始位点为基础的模型有效性。在交叉验证中,预期繁殖力和观察到的繁殖力值的相关系数大约是0.145。

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中国奶牛

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