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钦州市钦南区HIV-1分子流行病学研究

作者:沈平 苏齐鉴 黄毅毅 蒋丽萍 张达燕 郭继...亚型gag基因基因离散率

摘要:目的:了解钦州市钦南区HIV-1分子流行病学特征。方法:在钦南区采集100名未抗病毒治疗HIV-1感染者的血液样本,提取病毒RNA或前病毒DNA,采用逆转录/巢式PCR对HIV-1gag基因片段进行扩增并测序。使用MAGA5.03软件对所得序列进行系统进化树分析,并计算gag区及各编码区段的基因离散率。结果:获得72份样本gag基因序列,其中CRF01_AE重组型占72.2%(52/72),CRF07_BC重组型占13.9%(10/72),CRF08_BC重组型占12.5%(9/72),G亚型占1.38%(1/72)。CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC的gag基因离散率分别为0.049±0.004、0.053±0.005和0.059±0.005,差异具有统计学意义(P〈0.01)。各亚型p17基因离散率均大于p24基因(P〈0.01)。结论:钦南区HIV-1主要流行亚型是CRF01_AE,CRF 08_BC亚型离散率大于CRF 01_AE亚型和CRF 07_BC亚型。

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中国农村卫生事业管理

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