海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株多间隔序列分型

作者：程雪琴; 金玉明; 老世军; 黄昌和; 黄芳; ...斑点热群立克次体多间隔序列分型海南省澄迈县

摘要：目的 采用多间隔序列分型（MST）对从海南省澄迈县发热患者及野鼠分离的62株斑点热群立克次体进行分型研究。方法 根据文献检索,应用9对成功用于斑点热群立克次体MST分型引物,对实验62株菌进行PCR扩增及测序。校正后序列进行Blast分析。同时,对序列进行Megalign比对分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株细菌成功测序的6段间隔序列按一定顺序拼接并构建进化树。结果 使用6对间隔序列引物扩增实验菌株,结果显示每对引物扩增序列均显示较大的变异性,共获得48个变异型,以h3为代表的主要变异型占21.7%（13/60）,剩余的47个变异型为独立型,分别占1.6%。进化树分析结果显示48个变异型均归为一簇。同其他参考菌株比较发现,黑龙江立克次体与上述菌株关系密切。SNPs分析发现位点变异主要以T-C转换及A-G转换为主。结论 海南地区斑点热群立克次体分离株非编码间隔序列呈高度变异性。MST分型较传统的血清表型分型以及MLST分型更具有鉴别能力,对未来立克次体暴发流行可提供快速有效的流行株追踪。

注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社