大林姬鼠中汉坦病毒的分离及其S片段的序列分析

作者：王洪霞; 姚来顺; 王玉; 陈化新; 张永振; ...大林姬鼠汉坦病毒片段序列分析核苷酸序列系统发生关系病毒分离技术同源性分析tn型进化过程测序技术基因分型亲缘关系黑线姬鼠吉林省俄罗斯肺组织病毒株中国克隆标本

摘要：目的分析吉林省大林姬鼠携带的汉坦病毒(HV)在进化过程中的系统发生关系.方法采用病毒分离技术、逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、克隆以及测序技术对中国大林姬鼠携带的HV进行研究.结果从4只大林姬鼠HV抗原阳性的肺组织标本中分离到2株HV(CJI89和CJI93),对其中CJI93病毒株的S片段进行克隆、测序以及分析,基因分型结果为汉滩型(HTN)汉坦病毒.根据S片段的核苷酸序列同源性分析,CJI93与Aa2499核苷酸序列的同源性最高(94.396),而与Ap61、Ap63的同源性最小(83.3%,82.9%).由全S片段构建的HTN型汉坦病毒的系统发生树表明CJI93与Aa2499等俄罗斯黑线姬鼠携带的HV的亲缘关系最近,其次为中国的HTN型病毒,然后才是Ap61、Ap63等俄罗斯大林姬鼠携带的HV.结论从我国吉林省大林姬鼠分离到的CJI93株是HTN型汉坦病毒的新亚型.

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