作者：张路路; 全; 张跃华; 白雪; 韩诚武枯草芽孢杆菌分泌蛋白sec预测分析str生理功能分泌途径分泌系统
摘要：枯草芽孢杆菌是一类广泛存在植物和土壤中的具有较强抗逆性的革兰氏阳性益生菌,具有繁殖快,能抑制有害菌的生长等特点,是研究菌种的典型菌株。蛋白的Sec分泌途径的分析能够认识该菌株的生理功能和与宿主之间的作用机理。方法：Sec途径分泌蛋白具有I型信号肽的分泌蛋白Spase I和II型信号肽的分泌蛋白Spase II。首先在NCBI（www.ncbi.nlm.nih.gov）中下载枯草芽孢杆菌subtilis str168 Sec途径构件蛋白对应的氨基酸序列,然后用一系列生物信息学软件分析该菌基因组中Sec途径分泌蛋白信号肽、跨膜螺旋数和进行COG功能数据库对各类蛋白进行注释和功能聚分析。结果：结果显示Sec途径Spase I类肽酶识别的蛋白个数为172个,其中具有COG功能的蛋白有141个,Spase II类肽酶识别的蛋白个数为61个。结论：枯草芽孢杆菌外表面的分泌途径系统比较完整,是典型的研究菌株,但是对于Sec分泌途径的报道尚未有。本课题通过对枯草芽孢杆菌subtilis str168 Sec途径分泌蛋白信号肽和功能分析,得知该菌的Sec途径分泌蛋白的蛋白长度、编号、数量和COG功能等,为研究该菌的分泌系统提供了理论依据和基础。
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