新的具有高度多态性的日本血吸虫微卫星位点的鉴定

作者：殷明波 朱根凤 张祥林 徐斌 莫筱瑾 孙胜...日本血吸虫微卫星多态性中国

摘要：目的从基因组序列中选择和设定新的、可用于研究日本血吸虫多态性的微卫星位点。方法672个日本血吸虫标本取自安徽、江西、湖南、湖北和四川等5省的7个流行区现场。根据日本血吸虫基因组数据库中的初始数据设计引物，对标本的17个全新的日本血吸虫微卫星位点进行分析。用GenMapper4．0软件（Applied Biosystems）进行初始数据处理，用GenClone1．0软件计算种群内各标本的遗传距离；用GenAlEx6软件统计等位基因的变化；用GenClone1．0软件计算种群内各标本的遗传距离；用UPGMA谱系图分析种群间遗传距离。结果17个微卫星位点均呈现多态性。对江西都昌种群的这17个位点进行分析，标本之间的遗传距离大多为25～32，显示江西都昌种群内各个标本之间的遗传差异明显。对7个地区种群分析的结果显示种群间的差异较为明显。类平均法系统聚类分析（UPGMA）谱系图显示，江西都昌、安徽铜陵、湖北沙市和湖南常德的种群同为一簇，其遗传距离为0．0178--0．0363；安徽贵池和湖南岳阳的为另外一簇，其遗传距离为0．0247；而四川西昌单独为一簇，与其他两簇的遗传距离为0．0192～0．0693。结论选择的17个微卫星位点可作为研究日本血吸虫种群遗传学的有效标记，并揭示中国大陆该虫种存在着复杂的遗传变异。

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