作者：涂宜强; 李晓成; 杨增歧; 徐辉; 陈杰; 吴...e2基因编码序列猪瘟流行毒株pcr方法弱毒疫苗株序列分析hclv基因序列随机分布50年代分析结果抗原表位半胱氨酸变异核甘酸流行株研究所缺失碱基病毒行比亚群位点
摘要：利用RT-PCR方法获得16个猪瘟流行毒株、5株弱毒疫苗株和外来的4株猪瘟E2基因部分编码序列的扩增片断,并对其进行测序,获得659 bp含E2基因N段A、B、C、D四区域的编码序列.利用DNAstar软件对其中616 bp的片段进行序列分析,并与Genebank中的Alfort、Brescia、HCLV、Shimen等毒株进行比较,结果20株病毒所测序列均为猪瘟E2基因序列,所有毒株碱基替换随机分布于整个序列,部分毒株出现碱基缺失现象.序列分析结果表明近期流行的毒株不仅与50年代流行的Shimen株、现用的疫苗株距离较远,而且流行毒株呈不同亚群方向演变.本研究所测的20株流行株E2基因N端6个与C端的2个半胱氨酸(Cys)均未发生变异,但其他位点的核甘酸变异与缺失,引起各区的抗原表位呈现不同程度的变异.
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