作者:金梅; 张亭亭; 王艳杰; 曲杨乐; 徐明; 李...辽宁绒山羊umpcmp激酶基因生物信息学分析
摘要:在前期构建辽宁绒山羊皮肤cDNA文库的基础上,测通得到了新基因UMP/CMP激酶的全长序列,并对UMP/CMP激酶基因进行生物信息学分析。然后,通过RT—PCR检测该基因在心、肝、脾、肺及肾中的表达。生物信息学分析显示,UMP/CMP激酶基因全长1081bp,能够编码含有228个氨基酸的蛋白质,亮氨酸、甘氨酸、赖氨酸含量较高。UMP/CMP激酶含有较高比例的无规卷曲结构(51.75%),并发现其含有UMP/CMP激酶蛋白结构域。蛋白三级结构、进化树分析显示,辽宁绒山羊和牛的UMP/CMP激酶基因的同源性最高。UMP/CMP激酶基因存在跨膜结构域,并且存在信号肽剪切位点。该基因中有8个Ser,2个Thr,2个Tvr可能成为蛋白激酶磷酸化位点。RT—PCR检测显示,UMP/CMP激酶基因特异地表达于皮肤。这些研究结果为深入研究辽宁绒山羊的种质遗传特性奠定了基础。
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