作者：赵冬; 史艳; 刘维华; 李秀娟; 田会方; 高...甲型h1n1流感病毒血凝素基因特征
摘要：目的分析石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株血凝素蛋白（HA）的基因特征,了解其变异情况。方法选取石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株71株,PCR扩增HA基因并测序;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/California/07/2009进行对比;采用MEGA（5.05）软件NJ法构建进化树,进行系统进化分析。结果石家庄市71株分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA基因核苷酸同源性为96.86%~99.57%,氨基酸同源性为96.77%~99.11%,株间核苷酸同源性为96.30%-100.00%,氨基酸同源性为96.95%-100.00%;进化树分为2支,部分2013年分离株及2014年和2016年分离株与疫苗株发生偏离;与A/California/07/2009相比,分离株HA蛋白有7处抗原位点和4个受体结合位点发生变异,NetNGlyc1.0预测8个糖基化位点均未发生缺失,2016年的4个分离株在162位新增一个糖基化位点。结论石家庄市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因与疫苗株同源性逐年降低,氨基酸变异逐年增多,虽显示低致病性特征,但仍需继续对其加强监测。
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