作者：尹小丽; 王学政; 代运章; 张士娥; 朱有名...人乳头瘤病毒e7蛋白b细胞表位比对预测
摘要：目的预测并分析我国人群常见人乳头瘤病毒HPV16、18、33、52与58亚型E7蛋白的线性B细胞表位。方法在NCBI数据库中获取5种高危型HPVE7蛋白氨基酸序列,采用ClustalX2软件进行多序列比对;运用ExPASY服务器SOPMA和GOR4法预测二级结构,采用Kyte-Doolittle方案和Hopp-Wood方案预测亲水性;运用Bepipred和ABCpred软件预测B细胞表位,辅以抗原性指数,综合评判几率较大的B细胞优势表位。结果综合多参数分析,5种HPV亚型的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,其中预测的HPV16与52亚型的第16-21位氨基酸序列一致性为100%,均为QPETTD;HPV16型第28-41位（LNDSSEEEDEIDGP）与HPV52型第28-38位（LGDSSDEEDTD）的氨基酸序列一致性为78%;HPV16型第42-50位（AGQADEPRA）,HPV33型第31-46位（SSDEDEGLDRP）,HPV52型第36-46位（DTDGVDRPDGQ）和HPV58型第73-78位（TTTDVR）为各自的特异B细胞表位。结论生物信息学方法预测5种HPV的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,同时具有特异的B细胞表位（18型除外）,可为宫颈癌的诊断、预防和新型疫苗的研制提供参考。
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