作者：赵智娴 田炳均 张杰 汤晶晶 丁峥嵘柯萨奇病毒b组3型基因分型分子进化
摘要：目的探讨已公布的不同国家不同时间分离的人类柯萨奇病毒B组3型（human coxsackievirus B3,CB3）VP1区基因特征和分子流行特点。方法在GenBank中用BLASTN软件搜索不同国家/地区、不同时间发表的CB3VP1区基因序列,共得到来自8个国家的92个可用序列,用MEGA软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统进化树。结果 92株病毒可分为5个基因型（Genotype 1～5）,基因型1由CB3原型株Nancy和3个法国株组成,基因型2由4株美国株组成,基因型3的地理分布最广,由德国、美国、罗马尼亚、法国、日本、荷兰、瑞典分离株组成,基因型4由5株中国台湾分离株组成,基因型5由中国山东株、云南株和台湾株组成,该基因型又分为A～E 5个亚型。不同毒株的核苷酸差异率为6.90%～24.64%（氨基酸差异率1.00%～10.20%）,不同基因型之间的核苷酸差异率为15.91%～24.64%（氨基酸差异率4.02%～10.20%）。结论不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间,同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。
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