作者：张立成; 肖卫华; 彭沛宇; 廖健程; 丁鑫; ...轮作连作16srdna土壤细菌群落克隆文库
摘要：为了解南方地区稻—稻—油菜轮作后土壤中细菌群落的变化特征，以长达30年的水稻—水稻—油菜轮作和水稻—水稻连作定点栽培试验土壤为研究对象，采用克隆文库和基因序列分析法，通过细菌16S rDNA基因通用引物对土壤提取DNA进行PCR扩增，然后将扩增片段构建克隆文库对克隆子进行测序分析. 结果显示，2015年7月、10月和2016年4月3次取样中轮作土壤细菌的香农-维纳指数和辛普森指数均高于连作土壤，轮作土壤细菌多样性高于连作. 克隆子序列OTU与GenBank比对结果显示，轮作土壤中常见的变形菌（Proteobacteria）占细菌种类的55%，连作土壤为45%；轮作土壤芽单胞菌（Gemmatimonadetes）占细菌种类的13%，连作土壤为10%；轮作土壤中的酸杆菌（Acidobacteria）、厚壁菌（Firmicutes）和浮霉菌（Planctomycetes）所占细菌比例数小于连作土壤；变形菌和芽单胞菌构成了轮作土壤中的优势菌群，土壤优势菌群的变化对细菌群落结构特征产生影响. 测序结果显示稻—稻—油菜轮作土壤优势菌群中α-变形菌、β-变形菌和γ-变形菌高于稻—稻连作；稻—稻—油菜轮作中发现与绿弯菌（Chloroflexi）序列相似菌类，而稻—稻连作土壤中未发现. 本研究表明微生物群落结构组成与土壤耕作方式相关，稻—稻—油菜轮作增加了细菌群落丰度. （图3 表2 参20）
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