作者：刘炜姬; 倪珊珊; 林争春; 林玉玲; 赖钟雄植物mir408家族进化规律分子特征靶基因预测
摘要：miR408家族在植物上已有报道，但其进化规律与分子特性研究很少. 利用miRbase数据库提供的34种植物49个miR408的前体序列和64个成熟体序列，采用分类统计、进化树构建、序列比对、二级结构预测、染色体定位分析及靶基因预测等手段，进行进化规律与分子特性分析. 结果显示：miR408家族成员分布在34个植物物种中，分布较为广泛，并且苔藓类植物可能是植物miR408家族进化的祖先；物种特异性是影响miR408前体进化特性的重要因素，而序列保守性是影响成熟体进化特性的主要因素；由5p臂上形成的miR408成熟体的序列特异性较大，由3p臂上形成的miR408成熟体的序列保守较高；Mfold预测表明植物miR408家族具有典型的茎环二级结构，茎序列的保守性高于环序列，3p臂上茎序列的保守性高于5p臂上茎序列；靶基因预测表明miR408广泛参与植物生长发育和逆境胁迫的应答. 综上表明植物miR408家族成员在进化过程中保守性与特异性并存，这对进一步研究植物miR408的生物学功能具有参考价值. （图7 表3 参35）
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