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马铃薯晚疫病菌小种特异无毒基因候选表达序列的cDNA-AFLP鉴定

作者:郭军; 屈冬玉; 王晓武; 金黎平; 谢开云; ...马铃薯晚疫病菌无毒基因

摘要:利用具有6个无毒基因不同表现型且处于萌发中的静孢子时期的马铃薯晚疫病菌构建4个混合池,通过cDNA-AFLP分析,共获得85个与无毒基因相关的差异表达片段,其中与无毒基因Avr1、Avr2、Avr3-Avr10-Avr11、Avr4 相关的差异表达片段分别为20, 28, 16和21个.将这些差异表达片段对20个晚疫病病菌个体进行无毒基因差异表达验证,得到1个无毒基因连锁群Avr3-Avr10-Avr11的候选片段, 即A11T13Avr3-10-11S157; 无毒基因Avr4的候选片段2个, 即A24T19Avr4S122和A24T24Avr4S142.Blast分析表明:A11T13Avr3-10-11S157与马铃薯晚疫病菌萌发孢子囊(germinating sporangium)EST(expressed sequence tag)库中的序列PG001F10.XT7同源;A24T19Avr4S122与晚疫病菌萌发中静孢子(germinating cyst)EST库中的PH051G10.XT7部分序列完全一致,而A24T24Avr4S142与PH051G10.XT7具有98%的同源性.这些结果将促进通过电子克隆并结合RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)技术获得全长的无毒基因Avr4.

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