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常规PCR、实时定量PCR检测传染性皮下及造血器官坏死病毒的效果分析

作者:周优 岳志芹 梁成珠 徐彪 朱来华 高宏伟 ...凡纳滨对虾实时定量pcr常规pcr测序

摘要:对虾传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)可感染世界各地养殖对虾,给对虾养殖业造成严重经济损失。本实验首次采用实时定量PCR法对广西地区的84份凡纳滨对虾样品进行检测,同时以常规PCR检测作对照。实时定量PCR检测阳性率为79.8%,常规PCR检测阳性率为40.5%,表明广西地区养殖的凡纳滨对虾IHHNV的感染率较高。将二者检测均呈阳性的30份样品扩增产物进行序列分析测序,测序结果通过DNASTAR软件包进行分析,并通过NCBIB last与GenBank中的序列进行比对。结果证明,测定的是IHHNV序列。30份样品的IHHNV序列很保守,可以分为4种类型,仅有两个碱基的位置发生变异。实时定量PCR检测IHHNV,快速、灵敏、准确,特异性好,可以作为检测对虾感染病毒的有效方法。

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渔业科学进展

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