汉滩病毒西安分离株84FLi的S片段全基因序列测定及分析

作者：李新红; 杨为松; 杭长寿; 白雪帆; 马本江...汉坦病毒序列分析系统发生树84fli株

摘要：目的: 测定我国陕西西安出血热肾病综合征(HFRS)患者流产胎儿肝分离的病毒84 FLi株的全S片段基因序列,了解其分子特征,并确定其在汉坦病毒(HV)种系发生中的位置. 方法:采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),扩增出S基因的cDNA,直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体中测序. 结果:84 FLi株的全S基因共由1688个核苷酸组成,四种核苷酸的比例分别为A 31.39%、C 19.25%、G 23.04%和T 26.30%,GC含量为42.29%,AT含量为57.71%.最大开放读码框为37～1326,共编码429个氨基酸.核苷酸序列同源性分析表明,84 FLi株与汉滩病毒(HTN)型同源性高于与其他型HTV的同源性.84 FLi株与中国毒株Chen4和RG9同属于一个进化分支,而与HTN型国外毒株距离较远,属于不同的进化分支. 结论:84 FLi株属于HTN,并与国内分离的HTN同源性较高.

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