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基于网络药理学的黄芩汤治疗溃疡性结肠炎的潜在机制研究

作者:宋红新; 马旭冉; 王敦方; 王彦礼; 邹迪新...网络药理学黄芩汤溃疡性结肠炎作用机制靶点

摘要:利用网络药理学和系统生物学方法探究黄芩汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)分子机制。从中药系统药理学分析平台TCMSP挖掘黄芩汤中4味中药相关的化学成分和作用靶点;通过OMIM数据库、TTD数据库以及GeneCard数据库筛选UC的预测靶点。利用Cytoseape_v3.7.1软件构建化合物-靶点网络;基于STRING数据库,构建黄芩汤治疗UC靶点互作网络,根据拓扑学参数筛选黄芩汤治疗UC的核心靶点。利用Bioconductor中的R包clusterprofile version 3.12.0对疾病与药物交集靶点进行GO(gene ontology)生物学过程富集分析和KEGG(KEGG pathway analysis)通路注释分析。结果发现,黄芩汤化合物-UC靶点网络包含128个化合物和相应靶点141个,核心靶点涉及AKTI、IL6、PTGS2、IL10、IL1β等。GO功能富集分析得到151个GO条目,KEGG富集筛选得到33条和UC有关通路,主要涉及PI3K-AKT信号通路、NF-κB信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路等。本文预测了黄芩汤治疗UC疾病的可能作用机制,为进一步寻找其有效成分和作用机制奠定基础。

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