作者：郑汉; 虞慕瑶; 濮春娟; 陈美兰; 李福全; ...香樟生物信息学化学型表达分析
摘要：3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, HMGR)是萜类甲羟戊酸途径(mevalonic acid pathway, MVA)上的第一个限速酶,是细胞质中萜类代谢途径中的重要调控位点。本研究以5种化学型的香樟(Cinnamomum camphora)作为实验材料,基于转录组数据,从香樟cDNA中克隆出2个HMGR基因,分别命名为CcHMGR1 (GenBank登录号:MN163055)和CcHMGR2 (GenBank登录号:MN163056)。基因包含开放阅读框(ORF)分别为1 689 bp和1 683 bp,编码562和560个氨基酸残基,生物信息学分析推测其分子质量为59.819 kDa和59.397 kDa,等电点(theoretical pI)为8.20和8.61,均不含信号肽,存在2个跨膜结构。结合蛋白质保守区以及进化树分析,证实该基因确为HMGR家族基因。利用实时荧光定量PCR检测, CcHMGR1和CcHMGR2在香樟5种化学型中的表达模式类似,均在油樟中的表达量要高于另外4种化学型;并且2个CcHMGRs基因均在根中表达量最高,枝中最低。本研究首次从香樟中克隆出了CcHMGRs cDNA全长,并揭示了CcHMGRs在5种化学型及不同组织中的差异表达,为香樟萜类化合物生物合成途径关键酶基因的挖掘提供研究基础。
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