作者：乔永刚; 贺嘉欣; 王勇飞; 曹亚萍; 贾孟君...苦参叶绿体基因组ssr密码子偏好性比较基因组学系统发育分析
摘要：为探究苦参叶绿体基因组特征及该属物种的系统进化发育关系,本研究利用高通量测序技术对苦参叶绿体基因组进行测序和功能注释。结果显示:苦参叶绿体基因组全长154165 bp,呈典型的四段式结构。苦参叶绿体基因组共包含123个基因,包括77个蛋白编码基因、38个tRNA基因及8个rRNA基因。经序列分析鉴定出104个SSR位点,大部分重复由A和T组成。此外该叶绿体基因组密码子偏好性较弱,编码区偏向使用A和T碱基。对两个不同地区苦参叶绿体基因组进行比较分析发现了4个差异基因。基于最大似然法(ML)对苦参及其他16种豆科植物进行系统发育分析,发现苦参与其同属植物苦豆子的亲缘关系最近。本研究为苦参的遗传变异、育种以及系统发育分析等提供了重要的理论依据,具有一定的参考价值。
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