作者：陆振miseq高通量测序仿刺参肠道菌群
摘要：该研究基于MiSeq高通量测序技术对大连、烟台、霞浦和莆田地区养殖仿刺参( Apostichopus japonicus )肠道菌落结构进行分析。结果表明,大连、烟台、霞浦和莆田地区养殖仿刺参肠道测得的分类操作单元(OTUs)分别为455、542、440和242。四个样品菌群的物种丰度和优势菌种存在较大差别,其中莆田池塘养殖的仿刺参的肠道菌群比霞浦海上吊笼养殖高2倍多。烟台的仿刺参的丰富度最高,Simpson/Shannon指数达到4.78。四个产地仿刺参肠道中共检测到317个细菌种属。大连养殖仿刺参肠道的主要优势菌群为 Lutibacter (10.13%),属拟杆菌门的黄杆菌科,是一种兼性厌氧菌。烟台养殖仿刺参肠道的主要优势菌群为 Haliea (21.34%)和 Halioglobus (12.58%)。莆田养殖仿刺参肠道中乳球菌属( Lactococcus )、芽孢杆菌属( Bacillus )所占比例较高。在霞浦养殖仿刺参肠道中 Formosa 含量最高,占细菌总数的比例为87.06%,其次为乳球菌属( Lactococcus ),占细菌总数比例为7.71%。文章利用Miseq高通量测序技术对仿刺参肠道菌群结构进行分析,为今后进一步研究仿刺参肠道菌群与其摄食、消化、免疫等之间的关系提供了新的资料。
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