小麦EST-SSR的分析及其引物的开发

作者：刘林 孙来亮 兰茗清 杨静 查友贵 李成云小麦表达序列标签微卫星

摘要：为开发出具有丰富多态性的、新型的小麦EST—SSR标记，利用已公布的1071367条小麦表达序列标签（expressed sequencetags，EST）序列，对≥24bp的微卫星或简单重复序列进行了系统分析。结果表明，在所分析的小麦EST序列中，搜索到长度大于或等于24bp，基序匹配值大于80％的SSR序列32350个。在这些SSR中，单碱基SSR最多，数量达18075个，占SSR总数的55．9％；其次为3核苷酸SSR，共6106个，占SSR总数的18．7％，重复数大于30次以上的达444个，占所有3核苷酸SSR的7．2％。4核苷酸SSR数量最少，仅有696个，仅占SSR总数的2．2％。研究中收搜索到的6核苷酸SSR共1562个，其基序组成可分为145类，优势基序为AGCCGC（达214个）。以上结果说明小麦EST序列中含有丰富的SSR，这非常有利于开发多态性较高的EST—SSR标记。

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