小麦条锈病菌EST序列中微卫星的频率和分布

作者：刘林 胡燕玲 杨静 张庆 李进斌 李成云小麦条锈病菌表达序列标签微卫星

摘要：研究利用已公布的7 368条小麦条锈病菌表达序列标签（expressed sequence tags,EST）序列,对其EST序列中的微卫星（microsatellite）或简单重复序列（simple sequence repeats,SSRs）进行了系统分析。结果表明,在已公布的7 368条小麦条锈病菌EST序列中,共有2 642个SSR序列（长度大于15 bp,匹配值大于80%）,相当于平均3条EST序列中分布有1个SSR序列。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达2 320个,占SSR总数的87.8%;其次为三碱基SSR,数量为137个,约占SSR总数的5.2%;五碱基重复的SSR数量最少,为34个。且有的SSR的重复数较多,这将有利于小麦条锈病菌SSR分子标记的开发与应用。

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