7个地方鸡品种间遗传分化和聚类分析

作者：张学余 陈国宏 韩威 朱云芬 陆进红微卫星地方鸡种遗传分化聚类分析

摘要：利用29个微卫星标记，通过计算亚群体杂合度（Hs）、总群体杂合度（Ht）、遗传分化系数（Gst）和基因流（Nm），并基于Reynolds遗传距离、Nei遗传距离运用NJ和UPGMA聚类法构建4类聚类图，比较分析国家地方禽种遗传资源基因库保存的7个地方鸡品种（仙居鸡、鹿苑鸡、固始鸡、大骨鸡、河南斗鸡、狼山鸡和萧山鸡）间的遗传分化和亲缘关系。结果表明，7个地方鸡种29个微卫星标记的总群体杂合度和亚群体杂合度的平均值分别为0．642和0．551，平均遗传分化系数为0．142；7个地方鸡品种间，萧山鸡与鹿苑鸡的基因流动最大，为5．8327；狼山鸡与固始鸡的基冈流动最小，为0．8053；基于Reyonalds遗传距离运用NJ聚类法获得的7个鸡种间的聚类图较为准确地反映了7个地方鸡种间的遗传分化和亲缘关系。

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