作者：刘宇虎 钟东 柳娟 杨兴龙 张振书 肖冰 郭...结直肠癌基因克隆序列分析生物信息
摘要：目的研究干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因（interferon induced transmembrane protein 1．IFITM1）克隆、测序，对序列进行分析，并获取生物学信息。方法以IFITM1的cDNA为模板，用Pfu酶做PCR扩增，在EcoR Ⅰ和Hind Ⅲ双酶切后，将IF—ITM1的cDN段克隆到pUCm—T质粒，对重组的pUCm—T-IFITM1测序后，采用All GenBank＋EMBL＋DDBJ＋PDBSe—quences Database和Simple Modular Architecture Research Tool（SMART）对IFITM1的eDNA进行生物信息学分析。结果扩增后，含有IFITM1基因eDNA的PCR产物约1000bp，IFITM1的eDNA成功克隆到pUCm—T质粒并进行测序。序列分析结果显示，IFITM1结构cDNA全长683bp，有2个外显子。IFITM1的mRNA编码的氨基酸在37～57和87～107有2个跨膜区，编码125个氨基酸的多肽，其蛋白相对分子质量为14kDa。结论，IFITM1基因的成功扩增、克隆、测序，获取了IFITM1基因的eDNA、mRNA以及编码蛋白质氨基酸的生物学信息，有利于研究IFITM1基因与大肠癌的关系。
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