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细菌全基因组关联研究的方法与应用

作者:杨超; 杨瑞馥; 崔玉军; 包其郁全基因组关联研究细菌全基因组测序表型遗传机制

摘要:随着测序技术的发展和全基因组序列的不断积累,全基因组关联研究(genome-wideassociationstudy,GWAS)在人类复杂疾病研究中取得了丰硕成果,10余年间发现了数以万计的疾病风险因子。同样,GWAS也为探索细菌表型的遗传机制提供了新的工具。自2013年第一项细菌GWAS(bacterialGWAS,BGWAS)工作发表以来,目前已有10多项相关研究报道,分别揭示了细菌宿主适应性、耐药性及毒力等表型的遗传机制,极大加深了人们对细菌遗传、进化及传播等方面的认识。本文对目前BGWAS的研究方法、应用成果及存在的问题进行了总结,并对BGWAS的研究前景进行了展望,旨在为微生物学领域开展BGWAS研究提供参考。

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遗传

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