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首页 期刊 遗传 一种基于适配器连接介导的等位基因特异性扩增法测定多重SNP【正文】

一种基于适配器连接介导的等位基因特异性扩增法测定多重SNP

作者:汪维鹏; 倪坤仪; 周国华dna适配器snp多重pcrcyp2d6

摘要:建立了一种基于DNA适配器连接介导的等位基因特异性扩增法测定多重SNP。以CyP2D6基因中的5个SNP位点(100C〉T,1661G〉C,1758G〉T,2470T〉C和2850C〉T)为例,用PCR法预扩增得一段含所有待测SNP位点的长片段,然后用限制性内切酶将其消化成短片段,在连接酶的作用下与设计的DNA适配器(adapter)相连;该适配器的一端与限制性内切酶降解后留下的粘性末端相同,另一端带有一段公共序列。在两管中加入与适配器连接的片段作为PCR扩增模板,并分别加人SNP特异性引物和一种适配器特异性的通用引物进行PCR扩增,最后用凝胶电泳法分离PCR扩增产物。由于每管与SNP的两种特异性引物中的一种对应,可以根据每管中扩增片段的大小判断SNP的类型。通过凝胶电泳法可以一次分离与5种SNP类型相对应的引物特异性延伸反应产物;采用该法成功测定了20名健康中国人的CYP2D6基因中5个SNP位点的基因多态性,与限制性片段长度多态性法(RFLP)测定结果完全一致。该方法采用n+1种引物(n种SNP特异性引物和一种通用引物)进行n重PCR反应,极大提高了PCR反应的特异性,结果准确,可用于同时测定多个SNP位点。

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