作者:韩建康; 徐德顺; 吴晓芳; 纪蕾甲型流感病毒株基因分析地区分离株湖州市核苷酸同源性流行病学研究聚合酶链反应进化树分析序列测定基因特征分析处理病毒分离变异特征mdck细胞咽拭子漱口液逆转录
摘要:目的研究2009年湖州市流感的病原甲型H1N1分离株A/Huzhou/09(H1)的HA和NA基因特征。方法采用MDCK细胞对患者咽拭子和漱口液标本进行病毒分离,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA和NA基因并进行序列测定,用DNAstar和MegAlign等软件分析处理。结果湖州市甲型H1N1分离株的HA和NA基因为1706个核苷酸和1401个核苷酸,与其他地区分离株核苷酸同源性在99.5%~100.0%和99.7%~100.0%。进化树分析显示,湖州市甲型H1N1分离株(A/Huzhou/09)的HA和NA基因与其他地区分离株变化不大,几乎完全一致。结论甲型H1N1分离株的变异特征及亲缘进化,分析对流感的流行病学研究具有重要意义。
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