作者：蒋雨函; 李杨; 李艳茹; 李太元; 郑大浩; ...鸡爪苓菌核dna文库est分析生物信息
摘要：探求由鸡爪苓菌丝体形成菌核的关键结构基因,为深入研究该珍稀药用真菌的生长发育、代谢调控以及优质种质资源的开发、利用与保护提供理论基础。从鸡爪苓菌核全长cDNA文库中随机筛选500个单独克隆进行单方向测序,选取3条全长的ESTs序列进行蛋白质功能预测,并进行生物学信息分析。结果表明:获得455条有效的EST序列,经聚类分析得到单基因簇共349条,文库冗余度为23%;参照拟南芥功能分类标准,将BLASTx比对结果中具有已知功能的78条单基因簇分成9类,分别是代谢、能量、转录、蛋白质合成、细胞结构、胞内运输、信号转导、抗性防御及未确定分类;仅有183条获得1条或1条以上GO术语,其中细胞组分包括7个部分,分子功能包括5个部分,生物学过程包括16个部分。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
