作者:翟菊叶; 叶泽坤; 杨枢; 刘长青生物医学文献挖掘肺癌基因药物关系提取
摘要:目的:从海量生物医学文献中挖掘疾病-基因-药物三者之间的关联关系,为精准医疗与靶向治疗提供依据。方法:利用词典与规则相结合的方法识别实体,利用共现法和关联规则找出疾病-基因-药物间的关联关系,对存在关联关系的实体所在的句子通过SemRep工具得到实体之间的语义关联关系,采用R语言建立关联图。结果:以肺癌疾病作为检索条件,将在PubMed中检索出的文献作为语料库,获取肺癌相关的基因和药物间的关联关系、语义关系等信息。结论:该方法能够有效提高实体关系抽取的准确率明显优于利用词典识别的方法。
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