原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测

作者：陈冰 任松叶 赵秀娟 蔡禄大肠杆菌基因组核小体定位多样性增量二次判别

摘要：以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.

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