作者：裴颂文 王心怡 韦刚 吴百锋序列比对blast算法生物信息学多核流处理器
摘要：序列比对是生物信息学中最基本、最重要的操作，通过序列比对可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息。BLAST算法是序列比对中应用广泛的算法之一。基于多核流处理器GPU和CPU的异构乎台，提出了BLAST算法构造单词表和单词匹配扩展的并行化实现方法。实验证明构造单词表的计算性能获得3倍以上的加速比；单词匹配扩展采用的混合并行方式可以获得7倍左右的加速比，内部并行方式可取得3～4倍的加速比。
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