作者：钱春仙 高俊 刘林 杨静 李成云茶树表达序列标签微卫星
摘要：从NCBI数据库中下载到50776条茶树表达序列标签（expressed sequence tags,EST）序列,利用Tandem Repeats Finder程序,对≧24 bp的微卫星（简单重复序列）进行系统分析。结果表明,在所分析的茶树EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80%的微卫星序列5299个,在这些微卫星中,单核甘酸的最多,数量达3283个,占SSR总数的61.96%,其次为2核甘酸微卫星序列,共1113个,占微卫星总数的21%。4核苷酸微卫星数量最少,仅39个,占总数的0.74%,搜索到6核苷酸471个,其基序组成可分为83类,优势基序为AAAACT（130个）。以上结果说明茶树EST序列中含有丰富的微卫星,这非常有利于开发表达序列中的微卫星标记,为含有微卫星的基因的标识、表达提供了很好的基础。
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