巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg和ND4L基因克隆及多态性分析

作者：杜民; 叶德来; 牛宝珍; 段加明; 岳冉; 宋...巨魾nd3nd4l序列分析系统发育

摘要：为了解巨魾鱼的种质资源情况,采用PCR技术扩增克隆并测序,得到巨魾NADH dehydrogenase subunit-3（ND3）,精氨酸的转运RNA（tRNA-Arg）和NADH dehydrogenase subunit-4L（ND4L）基因全序列各12条.通过DNAMAN 5.2.2软件进行序列比对,采用MEGA 5.02软件进行碱基质量分数分析,计算遗传距离,并构建系统发育树.结果表明：巨魾鱼ND3基因序列全长为346bp,碱基质量分数A为26.2%,T为29.6%,C为28.8%,G为15.4%,其中A＋T质量分数（55.8%）高于G＋C质量分数（44.2%）,12个ND3基因序列存在5种单倍型,发生了5次转换,1次颠换,5种单倍型之间平均相对遗传距离为0.007;tRNA-Arg基因序列全长为71bp,碱基质量分数A为23.9%,T为23.9%,C为29.6%,G为22.6%,其中A＋T质量分数（47.8%）低于G＋C质量分数（52.2%）,12个基因序列完全一致;ND4L基因序列全长为297bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,碱基质量分数A为24.6%,T为26.3%,C为33.3%,G为15.8%,其中A＋T质量分数（50.9%）高于G＋C质量分数（49.1%）,12个基因序列完全一致;将巨魾鱼与鮡科的其他10种鱼类的ND3,tRNA-Arg和ND4 L基因用Minimum Evolution法（ME）构建系统发育树,发现12尾巨魾鱼单独聚为一支,这一结果与传统的形态学分类相似.

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