巨魾线粒体12S rRNA和16S rRNA基因克隆及多态性分析

作者：杜民; 牛宝珍; 贾梦应; 刘艳红; 艾加林巨魾12srrna基因16s系统进化

摘要：运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA,利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示：（1）得到954bp的12S rRNA基因序列和535bp的16S rRNA基因序列各12条;（2）12尾巨魾的12S rRNA基因、16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%,99.95%,99.89%;（3）12尾巨魾的12S rRNA,16S rRNA均表现出A＋T碱基含量高于G＋C碱基含量;（4）12尾巨魾的平均遗传距离为0.002,转换比颠换的平均值为3.065;（5）利用Neighbor-Joining（NJ）法构建的系统进化树表明魾属单独成一支,支持率达到99%,这一结果与传统的形态学分类基本相似.

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