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合作猪γ-IFN基因外显子4多态性分析

作者:马小军; 李娟娟; 王立贤; 罗玉柱; 魏恒; ...合作猪多态性

摘要:为了研究合作猪γ-IFN基因的多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点,各等位基因是否符合Hardy.weinberg平衡状态、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度,采用PCR—SSCP方法检测了138头合作猪γ-IFN基因外显子4的等位基因,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列,就基因型和等位基因单倍型序列数据开展分析。序列比对分析发现5个核苷酸多态位点,其中5284bp(A—G)、534lbp(G→A)、5371bp(A—G)为新发现突变位点。试验群体发现4种基因型AA、AB、AC和AD,其中A等位基因频率为0.9638,为优势等位基因。经χ2适合性检验,该群体处于Hardy—weinberg平衡状态(P〉0.05)。γ-IFN因遗传多态指数中,杂合度(He)、多态信息含量(PIc)、有效等位基因数(Ne)均较低,表明合作猪γ-IFN基因比较保守。

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畜牧与兽医

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