作者：王可; 孙健全; 孔文涛; 孔健; 孙芝兰猪圆环病毒山东省分离株orf2基因序列同源性优势基因型流行毒株pcv2流行病学分析氨基酸进化树分析规模化猪场序列存在区域亲缘关系免疫反应结构蛋白rflp分析genbank活性区
摘要：分别从山东省6个地区的猪圆环病毒2型(PCV2)阳性病料中PCR扩增ORF2基因.以ORF2为靶基因进行6个毒株的分子流行病学分析.序列同源性分析表明.6个毒株之间的核苷酸序列同源性为93.3%～99.7%,氨基酸序列同源性为92.3%～100%;氨基酸序列存在2个高变区,分别位于序列的57～90和190～220位区域,其中57～90区域位于结构蛋白的免疫反应活性区;遗传进化树分析显示,SDⅠ、SD Ⅲ、SDⅤ、SDⅥ与法国株和中国农大株共同形成一群,可能起源于共同的祖先;SDⅡ、SD Ⅳ与其他7株PCV2毒株共同形成另一大群,与海南株的亲缘关系最近;结合GenBank报道的山东境内分离的13个毒株的ORF2基因序列进行RFLP分析,可将该省PCV2流行毒株分为CHN-2H型、CHN-2F型、CHN-21型和二种新的基因型,命名为CHN-2J和CHN-2K型.其中,CH-2H型所占比例最高,为优势基因型,是引起该省规模化猪场暴发PCV2疾病的主要基因型,因此研制防治该省PCV2的疫苗应以此基因型为主.
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