作者：郝林琳; 刘松财; 赵志辉; 张明军; 李敏; ...启动子转录因子结合位点鹿茸
摘要：对鹿茸IGF-15’端调控序列进行生物信息学分析。提取鲜马鹿茸顶部组织基因组DNA，设计简并引物，利用PCR获得马鹿茸IGF-15’端调控序列及部分外显子（命名为CCS1074），用DNAMAN软件进行CCS1074与其他种属IGF-1基因的序列同源性分析；使用在线分析程序预测CCS1074的潜在转录因子结合位点并比较分析鹿茸区别于其他种属IGF-1的特有潜在转录因子，进行TATAbox、CpG岛、候选启动子区段及信号肽预测。结果获得了包含部分外显子的鹿茸IGF-1基因5’端（Genbank Accession No．DQ234266）；序列同源性分析表明鹿茸IGF-1与牛、羊IGF-1基因5’端存在差异；生物信息学分析表明：在CCS1074180～310base处存在CpG岛，在142～192、238—288、874～924、1359～1409base处可能存在启动子，存在253个潜在的转录因子结合位点；比较发现，ZF5F／ZF5．01和HAND／HAND2-E12．01是鹿茸IGF-1区别于牛、羊、人、猪、家鼠、斑马鱼IGF-1启动子区域的潜在转录因子，这些潜在转录因子与鹿茸生长的关系尚待进一步试验证实；综合分析表明CCS1074〈1～1580base为鹿茸IGF-15’端区域，1581—1966base为外显子1，1903—1966base为信号肽，1967～〉2087base为内含子1。
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