作者：陈玉红; 钟金城; 马志杰; 胡汉傈; 金双; ...大额牛克隆分子系统进化
摘要：对大额牛Myf-5基因进行PCR扩增、T—A克隆和序列分析，并应用DNAMAN4．0、BioEdit4．8．10、DnaSP4．10、Mega3．1等生物信息学软件同普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼9个物种相应基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对分析，在此基础上采用NJ、ME和UPGMA法对其编码区核苷酸序列构建了分子系统进化树。结果表明：①大额牛Myf-5基因由3个外显子和2个内含子组成，其大小分别为660、76、1226、852、407bp；外显子和内含子数与其他9个物种相同，但大小存在较大的差异；外显子与内含子连接区遵循GT—AG基因组成规则。②大额牛与普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼的Myf-5基因编码区核苷酸序列同源性分别为99．0％、90．0％、90．5％、90．5％、87．2％、84．8％、72．9％、64．3％、51．8％，相应的氨基酸序列同源性分别为99．6％、94．9％、94．6％、94．9％、89．9％、88．7％、81．6％、70．4％、56．6％，这说明大额牛与其他9个物种在Myf-5基因的编码区核苷酸和相应氨基酸序列上具有较高的保守性。③用NJ、ME和UPGMA等3种方法聚类构建的分子系统进化树表明，3种方法的聚类结果基本一致，即大额牛与普通牛首先聚为一类，人、黑猩猩、恒河猴也先聚为一类，这两类相聚后再依次同其他物种聚在一起。这与mtDNA、其他功能基因和动物学分类的研究结果一致，表明Myf-5基因适合用于物种间系统进化关系的研究。
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