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新吉细毛羊皮肤组织均一化全长cDNA文库的质量评价

作者:詹振宏 黄锡霞 田可川 吴伟伟 哈尼克孜·...新吉细毛羊cdna文库质量评价ests序列分析

摘要:通过对已构建新吉细毛羊皮肤组织的均一化全长cDNA文库进行活化,在此基础上进行EST生物信息学分析研究,期望能发现影响细毛羊羊毛性状的主效基因或相关基因。运用菌落PCR、菌液PCR、质粒快速鉴定3种方法对cDNA文库进行评价,通过测序,在NCBI上BLASTn搜索、比对及运用DNAstar等软件进行分析。初步鉴定的结果:cDNA文库的库容量(滴度)为1.57×10。pfu/mL,菌落PCR、菌液PCR阳性克隆的小片段率在80%~90%,克隆的片段大小在0.6~2.0kb,cDNA在300~500bp,而质粒快速鉴定的在90%,克隆的片段载体带大小3.5~5.0kb。质粒快速鉴定的效果好于其他两种方法,耗时相对短,同时小片段率高;cDNA文库保存完好,符合基因文库的质量要求,有足够大的库容量来保证筛选目的基因。通过对筛选的阳性克隆5’端随机测序,随后获得可读序列169条,经过相关生物信息查询之后,发现其中可能含有完整基因。

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新疆农业大学学报

《新疆农业大学学报》(CN:65-1173/S)是一本有较高学术价值的大型双月刊,自创刊以来,选题新奇而不失报道广度,服务大众而不失理论高度。颇受业界和广大读者的关注和好评。 《新疆农业大学学报》1996年在第二届全国农业期刊评比中荣获“优秀农业期刊奖”;1997年荣获第二届全国优秀科技期刊评比“三等奖”;1999年在全国高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期刊评比中荣获“三等奖”,英国《动物学记录》期刊。

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