作者:卢瑶; 胡金雪; 金鑫; 陈越; 陈勤; 卢海彬马铃薯植物磺肽素植物磺肽素受体生物信息学亚细胞定位
摘要:该研究采用同源克隆与PCR扩增方法,从马铃薯品种‘Desiree’中克隆植物磺肽素受体基因StPSKR 1和StPSKR 2的全长cDNA,并对其进行生物信息学分析及亚细胞定位分析,为深入研究StPSKR 1和StPSKR 2基因在马铃薯生长发育和生物胁迫中的作用提供理论依据。结果发现:(1)通过同源克隆与PCR扩增获得StPSKR 1和StPSKR 2的全长cDN段,并将其克隆到pGWB5-GFP载体;测序结果显示这2个基因编码的蛋白质与数据库给定的蛋白质序列保持一致,表明成功克隆到StPSKR 1和StPSKR 2基因。(2)StPSKR 1位于马铃薯1号染色体上,cDNA全长3042 bp,编码1013个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为112.16 kD,理论等电点6.27;StPSKR 2位于7号染色体,cDNA全长3135 bp,编码1044个氨基酸,相对分子量为114.99 kD,理论等电点6.19。(3)生物信息学分析显示,StPSKR1和StPSKR2都属于跨膜蛋白。(4)亚细胞定位结果显示,StPSKR1和StPSKR2均定位于细胞膜上。
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