作者：吴星; 张艳; 雍斌; 李州; 彭燕trfqr1生物信息学进化树基因表达
摘要：采用RACE和RT-PCR方法,克隆白三叶拉丁诺(Trifolium repens cv.‘Ladino’)的cDNA基因序列,命名为TrFQR1,对该序列进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测TrFQR1的表达模式。结果表明:(1)TrFQR1序列长为1 003 bp,开放阅读框为612 bp,编码203个氨基酸,该蛋白的理论分子质量21.88 kD,等电点为5.96,属于亲水性稳定蛋白,无信号肽,无跨膜结构域,在进化上高度保守,N端11~15位氨基酸和C端112~165位氨基酸是FMN结合位点。(2)TrFQR1表达模式分析显示,白三叶TrFQR1基因对于8种处理均有响应,但不同处理响应不同,其中:用25μmol/L SNP、10 mmol/L H 2O 2、5 mmol/L CaCl 2处理1.5 h以及15%PEG处理3 h时,白三叶TrFQR1基因相对表达量显著增加;在200 mmol/L NaCl和600μmol/L CdSO 4处理下,TrFQR1基因相对表达量随处理时间的增加而增加;4℃处理6 h和0.02 mmol/L NaHS处理1.5 h时,TrFQR1基因相对表达量显著减少。
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