作者：原晓龙; 陈剑; 华梅; 李云琴; 王娟; 杨宇...岩生树花rinrps基因生物信息学分析
摘要：为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因，找出其潜在化合物或蛋白，以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础，分析获得一个新的NRPS基因(RiNRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及antiSMASH、NRPSpredictor、NaPDoS、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌RiNRPS基因进行分析，结果显示,RiNRPS基因相对分子质量为702699.9，等电点5.83，为不稳定蛋白；其开放阅读框总长19098bp，编码6362个氨基酸；该蛋白不存在信号肽，为非分泌蛋白，定位于细胞质基质中；可能合成HC-toxin合成酶，可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽，此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
