作者：陈丽莹; 张玉满; 陈晓英; 方荣祥; 张莉莉茶树茶叶叶际内生细菌菌群土壤微生物群落16srdna测序
摘要：【目的】茶树（Camelliasinensis）为多年生常绿木本植物,其叶片用于生产茶叶。本论文通过测定茶树叶际内生细菌的菌群组成,比较叶际内生菌与土壤菌群的异同,以鉴定选择性富集于茶树叶际的内生细菌。【方法】本研究采集湖北宜昌邓村茶树,对茶叶表面进行除菌处理,提取茶叶及其内生细菌的总基因组DNA,通过细菌16S核糖体RNA基因（16S rDNA）保守区引物799F和1193R扩增16Sr DNA的V5–V7可变区序列,并通过Illumina二代测序平台对扩增子进行建库测序。【结果】茶叶内生菌群由变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）和极少量的梭杆菌门（Fusobacteria）5个门,共百余属组成,其中,甲基杆菌属（Methylobacterium）、代尔夫特菌属（Delftia）、微杆菌属（Microbacterium）、红球菌属（Rhodococcus）、Aureimonas和鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）等以较高丰度富集于叶片组织内部。约40%的茶叶叶际内生细菌也在相应的土壤中存在,表明其可能的土壤来源;非土壤来源的茶叶内生细菌达60%,如Aureimonas和Delftia等。【结论】本研究解析了茶树叶际内生细菌的群落组成与结构,分析了内生细菌的可能来源,为以叶际内生菌为靶标,改善茶叶品质、降解农药残留、防御茶叶病虫害的研究提供基础。
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