作者：邢睿 高庆波 张发起 李印虎 付鹏程 张金...454焦磷酸测序黄绿蜜环菌微卫星遗传多样性青藏高原
摘要：【目的】本研究利用454焦磷酸测序技术,对青藏高原黄绿蜜环菌（Armillaria luteo-virens）转录组进行测序,从获得的Expressed sequence tags（EST）序列中开发EST-SSR引物。【方法】利用高通量测序获得的EST序列设计微卫星引物,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳检测筛选出合格的微卫星引物。【结果】共得到了1997121条reads,总数据量超过80Mb,序列平均长度为449bp。对于所获得的reads进行拼接后得到了22236条非冗余的EST序列,其中含有2024条contigs（平均读长974bp）和20212条singletons（平均读长404bp）。在所有序列中共找到321条符合条件的含有SSR的序列,从中随机选择98对,成功开发出27对具有多态性条带的微卫星引物。利用采集自3个不同居群的66个个体对上述27对引物进行验证,有17对引物符合Hardy-Weinberg平衡且没有连锁不平衡现象。【结论】首次成功利用高通量测序技术开发的EST-SSR引物将会对今后黄绿蜜环菌遗传多样性的研究以及种质资源鉴定、遗传图谱构建等打下了坚实基础。
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