作者：杨静华; 于浩; 任一; 王磊; 冯露大肠杆菌o54特异基因稀有密码子多样性
摘要：破译了大肠杆菌O54 O-抗原基因簇的序列,序列全长14062bp.用生物信息学方法分析序列并鉴定基因,共确定10个基因,包括鼠李糖合成酶基因BDA和C(rmlBDA和rmlC),糖基转移酶基因,O-抗原转运酶基因,O-抗原聚合酶基因和合成磷酸丝氨酸侧链的基因及1个不能确定功能的开放阅读框.对rmlC的(G+C)%含量,稀有密码子含量及进化分析都表明大肠杆菌O54 O-抗原基因簇是在近期通过rmlC介导的重组形成,而且大肠杆菌O54和鲍氏志贺氏菌9型的亲缘关系很近.对UTP-葡萄糖-1-磷酸-尿苷转移酶基因(galF)和6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因(gnd)的进化分析揭示志贺氏菌属与大肠杆菌属在进化上属于同一个属.用PCR方法筛选出了针对大肠杆菌O54的特异基因,用于基因芯片或PCR方法对大肠杆菌O54的快速检测.
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