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靛玉红类CDK1抑制剂的同源模建、分子对接及3D-QSAR研究

作者:张青青 姚其正 张生平 毕乐明 周之光 张...细胞周期蛋白依赖性激酶1靛玉红比较分子场分析同源模建

摘要:细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点. 本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接. 分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及Discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3D-QSAR)模块(以下简称为DS)分别建立了3D-QSAR模型. 其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3D-QSAR模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r^2=0.909,r^2pred.2=0.836; DS:q^2=0.579,r2=0.971,r^2pred.2=0.795,其中q^2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数). 本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CDK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.

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物理化学学报

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