作者：张露; 郑辉; 吴启航; 占卫红; 赵隆麒; 李...结核分枝杆菌rv3607cb细胞表位
摘要：预测和筛选结核分枝杆菌Rv3607c的B细胞表位,预测和分析得出其优势B细胞线性表位和构象性表位。在NCBI数据库中获得结核分枝杆菌的Rv3607c蛋白序列,使用生物信息学在线软件辅助分析。采用SSPro方案预测Rv3607c蛋白二级结构,Bcepred软件分析Rv3607c各个氨基酸的亲水性、柔韧性、可及性、转角、极性、抗原性等物理化学性质预测蛋白B细胞线性表位,ABCpred服务器利用人工神经网络预测抗原序列中的线性B细胞抗原决定区域,综合SSPro、Bcepred和ABCpred的分析情况进行预测,确定了3个优势B细胞线性表位,分别为：GAEIADHVMDDQRVHA77-92、AAEIVAGPPRKLIETV61-76、GRHGVYDHERVAGQRF14-29。另使用EpiSearch方案利用噬菌体展示肽序列自动检测得到优势构象性表位1个,即G9,T11,G14,G26,R28,V30,D32,A62,I64,A66,I73,E74,T75,A96,D110,V111,A112,V113。笔者对Rv3607c蛋白的B细胞线性表位及构象性表位进行分析并获得多个可能的优势B细胞表位,以期为结核病预防性疫苗的制备及诊断靶标筛选提供参考。
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