基于多软件融合方法的真核生物基因启动子预测

作者：马闯 蹇易 黄慧艳真核生物启动子预测支持向量机

摘要：基于多个软件的预测结果，提出了一种融合方法（ComPromoter）提高真核生物基因启动子的预测精度．ComPromoter以ProKey、FirstEF和Eponine等软件对启动子的预测结果为基础，融合了可用于启动子识别的多个特征（包括ProKey预测结果中真阳性和假阳性的出现频率随投票距离以及预测分值变化的统计特征），并利用支持向量机构建了启动子预测模型．在人类ENCODE区域测试数据集上测试的结果显示，ComPromoter的Pearson相关系数CC值高于所融合的单个启动子预测软件．

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