作者：邢军; 徐垚; 刘文天; 郑洁; 李艳芸差异显示est生物信息学
摘要：目的:以生物信息学为研究方法,利用互联网基因组资源,对一组胃癌相关差异显示逆转录聚合酶链式反应方法获得的差异表达片段进行序列分析.方法:使用BLAST软件,将所得到的6条序列与EST数据库和基因组数据库进行比对分析,以期获得序列的特征信息,并筛选出有意义的EST序列.结果:显示有3条序列与非编码区长散布核元件LINE区域匹配;1条序列与CD9的外显子同源;1条为新的EST序列,已提交EST数据库并获得序列登陆号;1条序列尚须通过基因识别的方法进一步证实其特性.结论:通过生物信息学方法快速筛选获得胃癌相关已知EST序列1条,获得1条新EST序列,排除3条DNA污染序列.
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