作者：张陈华 张似青 杜波 滑志民 郑江平 殷宗...皖南黑猪imf含量克隆测序
摘要：对皖南黑猪心脏脂肪酸结合蛋白（H-FABP）基因5’-上游区和第二内含子的多态性进行分析及克隆测序,为开展皖南黑猪肉质性状分子育种奠定理论基础。采用PCR-RFLP（HinfⅠ、HaeⅢ、MspⅠ3种限制性内切酶）分子标记技术,分析了184头皖南黑猪H-FABP基因5’-上游区和第二内含子区的遗传变异情况,并对该基因的多态片段进行克隆和测序分析。结果显示：（1）在5’-上游区,HinfⅠ位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.62,表现为中度多态（PIC=0.359 6）;在第二内含子区,HaeⅢ位点上存在多态性,等位基因D的基因频率为0.92,表现为低度多态（PIC=0.130 7）;而MspⅠ位点上尚未检测到多态,基因型均为AA型;HinfⅠ＊位点上也存在多态性,等位基因B的基因频率为0.78,表现为中度多态（PIC=0.282 4）;（2）χ2检验表明,除5’-上游区HinfⅠ多态位点外,其他3个位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）;（3）对H-FABP基因3个多态片段进行克隆测序分析发现,HinfⅠ-RFLP是由于1 324 bp处存在T→C的突变引起,HaeⅢ-RFLP是由于1811bp处存在C→G的突变引起,HinfⅠ＊-RFLP是由于1 970 bp处存在C→T的突变引起。本试验确证了皖南黑猪H-FABP基因5’-上游区的多态位点并在第二内含子区检测到了HaeⅢ和Hinf＊Ⅰ多态位点,这可为进一步分析H-FABP基因不同基因型与IMF含量的关系,以及确定影响IMF沉积的主效基因提供一定的数据基础。
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